截至2019年4月，学校设有文学院、新闻与传播学院、政治与法律学院、马克思主义学院、历史文化与旅游学院、外国语学院、教育科学学院、数学与计算机科学学院、物理与电子信息学院、化学化工学院、生命科学学院（脐橙学院）、地理与环境工程学院、商学院、音乐学院、美术学院、体育学院、研究生院、国际教育学院、继续教育学院、红色文华学院，共有72个本科专业。
赣南师范大学文学院（School of Literature）：汉语言文学、汉语国际教育、文化产业管理
赣南师范大学新闻与传播学院（School of Journalism and Communication）：新闻学、教育技术学、广告学、播音与主持艺术、广播电视编导
赣南师范大学商学院（School of Business）：国际经济与贸易、会计学、财务管理、市场营销、人力资源管理、物流管理、信息管理与信息系统、电子商务
赣南师范大学政治与法律学院（School of Political Science and Law）：思想政治教育、法学、公共事业管理、劳动与社会保障、社会工作
赣南师范大学马克思主义学院（School of Marxism）：承担全校本科生和研究生思想政治理论课教学任务，现有马克思主义基本原理教研室、思想政治教育研室、马克思主义中国化教研室
赣南师范大学历史文化与旅游学院（School of Historical Culture and Tourism）：历史学、旅游管理、酒店管理
赣南师范大学外国语学院（School of Foreign Languages）：英语、日语
赣南师范大学教育科学学院（School of Educational Science）：应用心理学、教育学、学前教育、小学教育
赣南师范大学数学与计算机科学学院（School of Mathematics and Computer Science）：数学与应用数学、计算机科学与凶促润技术、信息与计算科学、网络工程、软件工程
赣南师范大学物理与电子信息学院（School of Physics and Electronic Information）：物理学、电子信息工程、电子科学与技术、数字媒体技术、电气工程及其自动化、通信工程
赣南师范大学化学化工学院（School of Chemical Science and Technology）：化学、应用化学、材料化学、化学工程与工艺、环境科学
赣南师范大学生命科学学院/脐橙学院（Institute of Navel Orange/School of Life and Environmental Science）：生物科学、园艺
赣南师范大学地理与环境工程学院（School of Geography and Planning）：地理科学、人文地理与城乡规划、自然地理与资源环境、地理信息科学、土地资源管理
赣南师范大学音乐学院（School of Music）：音乐学、舞蹈学、舞蹈表演
赣南师范大学美术学院（School of Fine Arts）：美术学、环境设计、产品设计、视觉传达设计、服装与服饰设计、表演（服装表演与设计）、动画
赣南师范大学体育学院（School of Sports）：体育教育、社会体育指导与管理、表演（体育表演）
赣南师范大学国际教育学院（International Education College）：是学校执行涉外政策、协调国际交流与合作事务的职能部门和办事机构，又作为教学学院，承担学校来华留学生及涉外项目学生的招生、培养和管理。
赣南师范大学继续教育学院（School of Continuing Education）：是学校成人高等教育的行政管理机构和办学单位。
赣南师范大学红色文化学院（Red Culture College）：2017年11月10日，赣南师范大学成立红色文化学院。
